在FCM檢測中，所有細胞均會產(chǎn)生非特異性熒光，最終結(jié)果是細胞自身非特異性熒光與特異性結(jié)合熒光的疊加效果。為排除干擾、確保結(jié)果可靠，需設(shè)置陰性對照——這是一類對照的統(tǒng)稱，核心目的是“確定陰性基準、排除假陽性"，根據(jù)干擾來源不同可分為空白對照、陰性細胞對照、同型對照等類型，其中空白對照是最基礎(chǔ)的類型，各類對照的具體功能與邊界如下：

1.1空白對照：排除“檢測系統(tǒng)"相關(guān)假陽性

空白對照指未添加任何熒光染色試劑的樣本（如僅含細胞和緩沖液的樣本），主要針對“檢測系統(tǒng)本身"的干擾，核心作用包括：

確定陰性細胞群的基礎(chǔ)位置，同時輔助判斷細胞大小、顆粒度等固有參數(shù)。

區(qū)分細胞的本底自發(fā)熒光與實驗過程引入的非特異性熒光（如試劑殘留、操作污染及儀器本底熒光等）。

調(diào)節(jié)儀器電壓參數(shù)，使陰性細胞信號處于各通道合適區(qū)間，避免電壓過低導(dǎo)致“壓線"或過高導(dǎo)致信號溢出。

直觀呈現(xiàn)細胞的本底信號水平，便于后續(xù)圈門分析時直接排除非特異性信號群體。

1.2陰性細胞對照：排除“細胞自身特性"相關(guān)假陽性

陰性細胞對照指已知不表達目標抗原的細胞樣本，包括未受目標抗原刺激或自然狀態(tài)下不表達該抗原或經(jīng)過基因敲除的細胞（如明確不表達CD3的HEK293細胞），主要針對“細胞自身特性"的干擾，核心作用包括：

排除特定細胞系因表面結(jié)構(gòu)、高自發(fā)熒光等固有特性導(dǎo)致的假陽性。

驗證檢測體系對“明確陰性細胞"的識別能力，確保實驗體系的特異性。

適用于新細胞樣本或未知抗原表達情況的檢測場景，作為陽性結(jié)果的“陰性基準"。

1.3同型對照：排除“樣本-抗體結(jié)合"相關(guān)假陽性

同型對照指用與特異性抗體同亞型、同熒光素的無關(guān)抗體染色的樣本，主要針對“抗體非特異性結(jié)合"的干擾，詳見“同型對照"章節(jié)。

3.1空白對照的正常信號標準：參數(shù)調(diào)節(jié)合適后，各檢測通道的陽性信號占比應(yīng)低于0.5%；若細胞自發(fā)熒光較強，僅靠補償調(diào)節(jié)難以消除，需結(jié)合實驗優(yōu)化（如更換熒光素、調(diào)整樣本處理方式）。

3.2對照選擇原則：單一對照無法覆蓋所有干擾，需根據(jù)實驗?zāi)康慕M合使用（如常規(guī)抗體染色實驗，需同時設(shè)置空白對照和同型對照）。

3.3局限性明確：空白對照不能替代同型對照/陰性細胞對照，因空白對照未涉及抗體結(jié)合、細胞特性等干擾，無法界定陽性門或排除細胞自身相關(guān)假陽。

這里對同型對照（Isotype Control）的意義做進一步闡明。

流式抗體通過Fab端與靶標進行特異性結(jié)合。但白細胞（除T細胞外）表面大多表達CD16、CD32、CD64等Fc受體，這些受體可與各種抗體的Fc端非特異性結(jié)合，出現(xiàn)非特異性染色，其中以單核細胞和巨噬細胞尤甚。此外，在活細胞的表面染色實驗中，單核細胞和巨噬細胞均存在吞噬抗體的現(xiàn)象。在多色流式實驗中，還存在熒光背景的影響及藥物處理的影響，即便對Fc受體進行了封閉，在分群不好的情況下，依然需要用到同型對照。

同型對照是用于消除抗體非特異性結(jié)合到細胞表面而產(chǎn)生的背景染色，由與一抗具有相同種屬來源、免疫球蛋白亞型、亞鏈和熒光標記方式的非特異性免疫球蛋白構(gòu)成。與一抗保持相同的熒光染料-蛋白比值，以準確設(shè)定陰陽性閾值。其原理是通過匹配一抗的Fc區(qū)特征，阻斷Fc受體或補體介導(dǎo)的非特異性結(jié)合，從而驗證抗體結(jié)合的特異性。如果沒有適合的同型對照，在保持種屬來源、熒光標記方式、免疫球蛋白類別相同的條件下，優(yōu)先選擇的順序應(yīng)該是類別相同→亞型相同→亞鏈不同。

實驗時，如果僅僅參照陰性對照來圈門，就可能出現(xiàn)一部分假陽性結(jié)果。如果參考同型對照來區(qū)分陰陽性，就能夠把這部分非特異性結(jié)合造成的假陽性排除。但同型對照只能作為一種參考，不能直接以此為依據(jù)來確定陽性陰性分界點，或以此圈門。因為同型對照只能反映非特異性結(jié)合的背景熒光，不能排除其他相關(guān)影響因素。

造成非特異性染色的原因有多種，同型對照可以指示實驗步驟是否需要進一步優(yōu)化。如果是由于細胞未封閉，同型對照與Fc受體結(jié)合，則應(yīng)該優(yōu)化封閉條件。如果是由于死細胞的存在，則需要同型對照與活死細胞染料聯(lián)合使用。

1.排除抗體因電荷、結(jié)構(gòu)等特性與細胞表面非特異性結(jié)合產(chǎn)生的假陽信號。

2.精準界定染色樣本的陽性門位置，這是空白對照無法實現(xiàn)的功能，因為空白對照未涉及抗體結(jié)合過程。

3.驗證陽性信號是否來自特異性的抗原-抗體結(jié)合，尤其適用于弱表達抗原的檢測場景。

1.對于陰陽性分群明顯的指標，不需要同型對照即可設(shè)門，例如CD3、CD4、CD8等用于T細胞的檢測指標。對于陰陽性分群不清楚的指標，例如CD25、CD69、CD38等活化指標，及IFN-γ、IL-4、IL17A等細胞因子，則需要設(shè)置同型對照。

2.在某些特殊情況下，如單核細胞被PE/Cy7、APC/Cy7等串聯(lián)染料標記的抗體染色時，因為單核細胞一般傾向于與Cy7等染料非特異性結(jié)合，使用同型對照有助于獲得理想結(jié)果。

3.不清楚抗原表達情況的時候，一定要使用同型對照來界定陰性細胞群。

4.胞內(nèi)染色時，因為胞內(nèi)指標表達量一般不會太高，胞內(nèi)染色過程也非常容易導(dǎo)致抗原抗體非特異性結(jié)合。

1.購買同一廠家的流式抗體和同型對照，不同廠家的熒光染料和抗體結(jié)合的比率可能是不同的。

2.流式抗體和同型對照的使用劑量和濃度需保持一致。

3.細胞非特異性熒光的強弱由細胞本身所決定，與細胞的體積大小有關(guān)，一般細胞體積越大，其非特異性熒光就越強；體積越小，其非特異性熒光就越弱。分析每一種細胞時，都需要設(shè)定這種細胞的同型對照，不能用一種細胞的同型對照值分析另外一種細胞，尤其是在體積相差較大時。

4.在進行多色流式實驗時，熒光滲漏對結(jié)果的影響較為明顯，同型對照無法反映出其它通道滲漏的熒光背景。這時就需要通過同型對照與熒光減一對照（Fluorescence Minus One, FMO）的聯(lián)合使用，即減一對照與被去掉的抗體對應(yīng)的同型對照抗體的組合對照，消除熒光溢漏和非特異性結(jié)合造成的影響。